CallDoc

Institutul pentru Designul Proteinelor de la Universitatea din Washington a lansat un model AI co-dezvoltat cu Nvidia

CallDoc
Institutul pentru Designul Proteinelor de la Universitatea din Washington a lansat un model AI co-dezvoltat cu Nvidia

Modelul RFD4-Proteina permite proiectarea proteinelor de până la 10 ori mai rapid decât instrumentele anterioare, beneficiind de un grant masiv de putere de calcul.

Institutul pentru Designul Proteinelor (IPD) al Universității din Washington a lansat, miercuri, 21 octombrie, RFD4-Proteina, un model AI open-source co-dezvoltat cu producătorul de cipuri Nvidia. Modelul generativ utilizează „raționamentul biomolecular” pentru a îmbunătăți proiectarea de proteine cu funcții specifice, fiind capabil să genereze candidați de proteine de 5 până la 10 ori mai rapid decât instrumentele precedente, cu rate de succes similarly crescute, conform datelor confirmate prin teste de laborator.

Dezvoltarea modelului a fost accelerată printr-un grant de calcul „transformator” oferit de Fundația Jen-Hsun și Lori Huang, cofondată de CEO-ul Nvidia, Jensen Huang, și soția sa. Această finanțare a pus la dispoziția IPD aproape 7 milioane de ore GPU prin compania de cloud CoreWeave, accesul începând în iunie pentru o perioadă estimată de un an. Înainte de acest grant, cercetătorii depindeau de un cluster intern limitat, fiind nevoiți să prioritizeze experimentele săptămânale datorită capacității reduse.

RFD4-Proteina combină instrumentele RosettaFold Diffusion ale IPD cu sistemul Proteina-Complexa al Nvidia. David Baker, directorul IPD și laureat al Premiului Nobel pentru Chimie în 2024, a declarat că acest model va deschide calea către noi soluții în medicină, sustenabilitate, materiale și biotehnologie. Jensen Huang a subliniat faptul că majoritatea medicamentelor importante ale viitorului vor proveni din proteine care nu au existat niciodată în natură, iar sprijinul fundației vizează extinderea frontierelor medicinei prin disponibilitatea open-source a modelelor și datelor rezultate.

Aplicațiile potențiale includ dezvoltarea de candidați pentru medicamente împotriva bolilor actual intratabile, terapeutice precise pentru cancer, vaccinuri durabile și enzime capabile să degradeze substanțe chimice toxice sau materiale plastice. Un cercetător IPD a exemplificat eficiența noului instrument menționând că a proiectat în câteva zile o enzimă pentru degradarea pesticidelor care performează mult mai bine decât versiunea anterioară, realizată în luni de zile.

Proiectul a fost condus de studenții doctoranzi Nathaniel Corley, Maxwell Kazman și Rafi Brent, împreună cu Kieran Didi, student vizitator de la Universitatea din Oxford. Lansarea oficială a fost anunțată de Nvidia în cadrul conferinței GTC Berlin din 21 octombrie. Softul este disponibil sub licența Berkeley Software Distribution și poate fi accesat prin partenerii Nvidia, inclusiv Google Cloud, Microsoft Azure, Amazon Bio Discovery și Hugging Face.

Surse